Fattura elettronica alla clinica: il professionista non deve più pagare un secondo programma (2026)

Aggiornamento, 16 ottobre 2026. La fattura elettronica B2B costa 0 € anche nel piano Gratis. Il nostro canale SdI accreditato presso l'Agenzia delle Entrate è in produzione per invio e ricezione, e dal 10 novembre 2026 la fattura parte da Sanovia per tutti, con l'esito sulla riga della fattura. Il resto dell'articolo racconta come ci siamo arrivati; i prezzi aggiornati sono sulla pagina Prezzi.

Due fatture diverse, due strade diverse

Come medico privato emetti due tipi di fattura che per il fisco non hanno niente in comune.

La prima è quella al paziente. Cartacea o PDF, mai via SdI: il divieto è strutturale dal 2025 e i dati vanno al Sistema Tessera Sanitaria. Ne abbiamo scritto in Fattura elettronica e prestazioni sanitarie: il divieto ora è definitivo.

La seconda è quella a un soggetto con partita IVA: la clinica dove fai ambulatorio, il poliambulatorio che ti riaddebita o ti paga i compensi, la società per cui fai la medicina del lavoro, il collega che ti chiede una consulenza. Qui vale la regola opposta. La fattura elettronica via Sistema di Interscambio è obbligatoria, con il file XML nel formato FatturaPA, il codice destinatario o la PEC del cliente, e la conservazione a norma per dieci anni.

Questo articolo riguarda solo la seconda. Se ti capita anche una volta al mese, sai già dove finisce: in un secondo programma.

Il secondo abbonamento che quasi ogni medico paga

Il gestionale medico tiene agenda, cartelle e fatture ai pazienti. La fattura alla clinica, invece, quasi sempre la fai altrove: un programma di fatturazione, il portale gratuito dell'Agenzia, il commercialista. Due sistemi, due anagrafiche clienti, due numerazioni da tenere allineate, e a fine anno un registro da ricostruire a mano.

Il costo ha tre voci:

1. L'abbonamento del secondo programma. Sotto trovi i listini, letti il 21 settembre 2026.
2. Il tempo: ogni fattura B2B ricopiata da un sistema all'altro, ogni ricevuta di consegna da andare a cercare.
3. Gli errori: un numero saltato, una controparte con la partita IVA sbagliata, uno scarto dello SdI che nessuno ha visto perché la notifica è arrivata su una PEC che non apri.

Abbiamo deciso di togliere la prima voce del tutto e le altre due quasi.

Cosa fa Sanovia oggi

La fatturazione B2B è inclusa in ogni piano, anche nel Gratis a 0 €; nel piano Gratis rientra nei 365 documenti fiscali l’anno, oltre i quali puoi acquistare documenti illimitati per 12 mesi a 10 € IVA esclusa, senza rinnovo automatico. Studio costa 29 € al mese IVA esclusa e i documenti non si contano. Emettere la fattura e scaricarne l'XML funziona da settembre 2026; l'invio allo SdI dal nostro canale è per tutti dal 10 novembre 2026. Concretamente:

• Anagrafica controparti separata dai pazienti: cliniche, società, professionisti, con partita IVA, codice fiscale, codice destinatario a sette caratteri o PEC. Il sistema rifiuta un codice destinatario malformato prima che lo SdI lo scarti.
• IVA per riga con le nature corrette (le sole sottocategorie ammesse dal 2021: N2.1, N2.2, N4 e le altre), riepiloghi calcolati come li controlla lo SdI, al centesimo, senza arrotondamenti su virgola mobile.
• Marca da bollo calcolata come impone la norma sulle fatture elettroniche: sulle righe esenti o fuori campo, sopra i 77,47 €, dichiarata come bollo virtuale nel file. Se già usi Sanovia per i pazienti, la logica del bollo la conosci.
• File XML FatturaPA (formato FPR12) validato contro lo schema ufficiale dell'Agenzia, con i caratteri fuori standard corretti da soli: il simbolo dell'euro o un apostrofo tipografico in una descrizione bastano a far scartare un file, e li sistemiamo prima.
• Ritenuta d'acconto del 20% quando sei in regime ordinario e il committente è sostituto d'imposta (per ogni committente decidi tu se lo è): calcolata su tutte le prestazioni, esenti o con IVA, esclusi bollo e rimborsi spese. Il file riporta il totale e il netto a pagare, con la modalità di pagamento. In regime forfettario non si applica.
• Nota di credito (TD04) collegata alla fattura che rettifica, totale o parziale (per aliquota IVA), con la ritenuta ricalcolata sull'importo stornato.
• Registro unico o sezionale: le fatture B2B possono entrare nella stessa numerazione delle fatture ai pazienti oppure in un sezionale dedicato, che ti suggeriamo perché tiene le fatture elettroniche separate da quelle cartacee inviate al Sistema TS. Lo attivi con un clic dal profilo fiscale. In entrambi i casi la serie è senza buchi.
• Numerazione che continua: finché nell'anno non hai emesso un documento da Sanovia in quella serie, il numero della prossima fattura si imposta a mano. Passi a metà anno senza buchi e senza ricominciare da 1.
• Anche dal front desk della struttura: se lavori in una clinica su Sanovia, la segreteria emette lo stesso file dallo stesso motore, con la stessa numerazione.

Dal 10 novembre 2026 non resta nessun passaggio a mano: premi «Invia allo SdI» sulla riga e la fattura parte dal nostro canale. Fino a quel giorno scarichi il file e lo carichi sul portale Fatture e Corrispettivi dell'Agenzia delle Entrate: due minuti, gratis, nessuna firma digitale richiesta. Le fatture inviate così sono a tutti gli effetti fatture elettroniche.

Il nostro canale SdI, accreditato presso l'Agenzia delle Entrate

Quel passaggio a mano non ci piace, e non lo abbiamo risolto comprando un intermediario da rivenderti a canone.

Abbiamo chiesto all'Agenzia delle Entrate l'accreditamento di un canale SdI nostro, lo stesso tipo di collegamento che usano i grandi software di fatturazione. La richiesta è partita a settembre 2026. L'Agenzia delle Entrate ha accreditato la trasmissione il 9 ottobre e la ricezione il 14 ottobre 2026; dal 16 ottobre 2026 il canale è in produzione in Sanovia nelle due direzioni (codice destinatario GN8XM7S), e dal 10 novembre 2026 l'invio è aperto a tutti. Ecco cosa cambia:

• la fattura parte da Sanovia con «Invia allo SdI», e lo stato la segue: in coda, inviata, consegnata, scartata, con il motivo dello scarto in italiano e non con il codice 00404;
• se lo SdI la scarta, correggi lì: «Correggi il cliente» o «Correggi il profilo fiscale», poi «Reinvia allo SdI»;
• le ricevute dello SdI tornano dentro il registro, accanto al documento, senza cercarle in una casella PEC;
• la numerazione dei file la gestiamo noi, così due professionisti non possono mai collidere;
• la ricezione: in Fiscale → «Fatture ricevute» trovi il codice destinatario Sanovia. Lo registri una volta su Fatture e Corrispettivi e le fatture dei fornitori arrivano qui.

Per chi arriva da un altro programma c'è l'importazione dello storico: carichi lo ZIP di Fatture in Cloud, l'export di Aruba o i file XML del portale, e Sanovia ricostruisce le fatture con il numero originale, crea le controparti e ti propone da che numero continuare.

Come si fa, passo per passo, è nella guida Come si fa una fattura in Sanovia.

Quanto costa: zero in più

Ecco i listini pubblici, letti il 21 settembre 2026 sulle pagine prezzi di ciascun fornitore. Se un sito non pubblica un numero, la cella lo dice. Comparazione tra fatti pubblicati, non giudizi. Ogni cella riporta quello che il listino pubblico del fornitore diceva in quella data. Hai trovato un errore? Scrivi a prezzi@sanovia.app: correggiamo entro 5 giorni lavorativi.

Come leggere la tabella.

• Il confronto giusto non è Sanovia contro un programma di fatturazione. Un medico non sceglie tra un gestionale e un programma di fatturazione: ha il gestionale e in più paga il programma di fatturazione. La riga che risparmi è quella del secondo abbonamento, qualunque sia.
• Il primo anno non è il prezzo. Fatture in Cloud e Fattura24 pubblicano un prezzo promozionale per dodici mesi e uno di rinnovo. Nella tabella ci sono entrambi.
• «+ IVA» compare dove il fornitore lo scrive. Sanovia pubblica in homepage i numeri di questa pagina.
• I gestionali medici che includono lo SdI esistono: ArzaMed lo elenca nel piano da 99 €/mese, AlfaDocs lo dichiara senza prezzo. La differenza è il canone in cui è compreso.

Quanto risparmi, in pratica

Prendi un medico in regime forfettario che fattura a due cliniche.

• Con Fatture in Cloud Forfettari paga 48 € + IVA il primo anno e 96 € + IVA dal secondo, più 1 € + IVA di gestione a rinnovo: circa 118 €/anno IVA compresa dal secondo anno, per 100 documenti.
• Se supera i 100 documenti o esce dal forfettario, il piano Standard costa 144 € + IVA: circa 176 €/anno.
• Con Aruba paga 29,90 € + IVA: circa 36 €/anno.

Con Sanovia puoi emettere fino a 365 documenti fiscali l’anno a 0 €, fra ricevute, fatture e note di credito. Oltre, acquisti documenti illimitati per 12 mesi a 10 € IVA esclusa, senza rinnovo automatico. Se hai già Studio per agenda senza limiti di visite, cartella e promemoria WhatsApp, i documenti non si contano e sono inclusi nei 29 € al mese IVA esclusa. Il risparmio va da qualche decina a qualche centinaio di euro l'anno a seconda del programma che lasci, ed è sicuro, perché il canone Sanovia non cambia se fai una fattura B2B al mese o trenta.

Il risparmio più grande non è in euro. È un sistema solo: una controparte inserita una volta, un registro, una numerazione, e il commercialista che scarica tutto da un posto.

Perché lo diciamo per primi, e con che parole

A quanto risulta dai listini pubblici letti il 21 settembre 2026, nessun gestionale medico con prezzo pubblico include la fattura elettronica B2B nel canone base a 29 € al mese, senza modulo e senza secondo abbonamento. I gestionali che la offrono la comprendono in canoni più alti o non pubblicano il prezzo. I programmi di sola fatturazione la fanno bene, ma sono un secondo programma.

Lo scriviamo così, con la data e il perimetro, perché è l'unico modo di dirlo che regge tra sei mesi. Se un fornitore pubblica una riga che ci contraddice, aggiorniamo questa pagina.

Cosa facciamo, e cosa ancora no

• L'invio allo SdI lo facciamo noi, dal nostro canale accreditato: per tutti dal 10 novembre 2026, con «Invia allo SdI» sulla riga della fattura. Prima di quella data emetti e scarichi l'XML; alcuni account hanno già l'accesso anticipato.
• La ricezione delle fatture dei fornitori c'è, dal 16 ottobre 2026, in Fiscale → «Fatture ricevute».
• Fatture alla Pubblica Amministrazione (formato FPA12): Sanovia le prepara, con codice univoco ufficio, ordine NSO, CIG o CUP e scissione dei pagamenti. Le firmi tu con il tuo strumento di firma digitale, carichi il file firmato (.p7m) e Sanovia lo invia allo SdI; oppure le firma e le invia il tuo commercialista, che le trova nel suo pacchetto.
• Clienti esteri: non ancora supportati.
• Firma digitale: non la applichiamo. Per le fatture B2B non serve; per quelle alla PA la metti tu, con il tuo strumento, o il commercialista.
• La cassa previdenziale va in fattura. Al professionista iscritto all'ENPAM non serve: la cassa non prevede rivalsa in fattura. Per gli altri c'è la rivalsa INPS gestione separata o il contributo integrativo della cassa privata (ENPAP, ENPAPI, ENPAB): lo attivi dal profilo fiscale e l'aliquota la confermi tu.
• Conservazione a norma: non la facciamo noi. Aderisci una volta a quella gratuita dell'Agenzia da Fatture e Corrispettivi.
• Le scelte fiscali restano tue e del commercialista: natura IVA della prestazione, regime, sezionale. Sanovia scrive nel file quello che imposti nel profilo fiscale; non decide al posto vostro.

Come si passa, senza rifare niente

1. Inserisci le controparti che fatturi (o aspetta l'importazione dello storico, che le crea da sola).
2. Nel profilo fiscale imposta il numero della prossima fattura uguale all'ultimo emesso più uno. Puoi farlo finché nell'anno non hai emesso nulla da Sanovia.
3. Se il vecchio programma faceva la conservazione per te, aderisci una volta a quella gratuita dell'Agenzia da Fatture e Corrispettivi, indicando una data di inizio retroattiva così entrano anche le fatture già emesse.
4. Emetti la prima fattura B2B da Sanovia e premi «Invia allo SdI» (dal 10 novembre 2026; prima di quella data scarichi il file e lo carichi tu).
5. Disdici il secondo abbonamento dopo aver verificato, non prima.

Prova Sanovia gratis, senza carta

La fatturazione B2B è inclusa in ogni piano, anche nel Gratis a 0 €; Studio costa 29 € al mese IVA esclusa, contratto mensile, disdici quando vuoi con 30 giorni di preavviso. I prezzi sono quelli della homepage. Il piano Gratis costa 0 €, senza carta e senza scadenza: 365 documenti fiscali l'anno, 30 visite al mese e 365 pazienti in archivio. Oltre i 365 documenti, puoi acquistare documenti illimitati per 12 mesi a 10 € IVA esclusa: un solo pagamento, senza rinnovo automatico, valido per 12 mesi dal pagamento. Se passi a Studio mentre i 12 mesi sono ancora in corso, i 10 € vengono scalati dal primo addebito. Studio ha 30 giorni di prova senza carta, poi 29 € al mese o 290 € all'anno, IVA esclusa; chi si registra prima del 10 novembre 2026 ha Studio gratis fino al 31 dicembre 2026.

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